А наличие или отсуствие диплома Вам ничем не поможет и не ухудшит Ваше положение в связи с повесткой из военкомата. Один мой знакомый в связи с такой ситуацией просто поступил в платную аспирантуру и у него приняли вступительные экзамены за отдельную плату еще в июле. Соотвественно и зачислили его в аспирантуру в июле месяце.
PS: аспирантура была в его вузе, где он обучался на магистра.