А военкомату какая разница работаешь ты или нет? Это не их проблемы! В законе не сказано, что аспирант не имеет права работать. Если учебный план выполняешь, то можешь работать сколько угодно, хоть на 3-х работах. На стипендию все-равно не проживешь!